房地合一課稅新制要注意的是：保存房地原始取得成本費用的相關憑證，否則就要多繳很多稅了。

新制課稅所得＝交易時成交價額－原始取得成本－取得、改良及移轉費用－土地漲價總數額。

如果沒有檢附原來買進成本的證明文件，國稅局會依查得資料核定買進成本費用，如查不到資料，就會用買進時的房屋評定現值及公告土地現值，按消費者物價指數調整後，核定買進成本。

因為是按照房屋評定現值、公告土地現值計算，而不是用實際價格計算，這樣一來，買房子的成本會被壓得很低。其次，費用也只能按成交價額的5%計算。

舉例來說，甲君2014年8月1日買入A房地，2016年6月10日出售，售價900萬元，土地漲價總數額為85萬元，由於甲君無法提供買進房地成本費用的相關憑證，國稅局也無法查得甲君取得成本費用的資料，買進時房屋評定現值及公告土地現值為250萬元，當時的消費者物價指數為100，出售時的物價指數為108。

國稅局就會以調整後的價值270萬元（250萬元×108／100）計算甲君的成本，另按成交價額的5%計算費用為45萬元，核定甲君的房地課稅所得為500萬元，即成交價額900萬元－消費者物價指數調整後的房屋評定現值及公告土地現值價值270萬元－費用45萬元－土地漲價總數額85萬元，再乘以持有期間未逾二年適用的稅率35%，應納稅額為175萬元。