財政部表示，今年開始實施房地合一課稅新制，房產利得課稅方式也進入雙軌並行年代。民眾購買土地後再自建房屋並出售，因土地與房屋取得日期不同，會出現房屋及土地分別適用新、舊制課稅的情形。

依據財政部規定，自地自建案件中，土地取得日期若是在去年12月31日以前，自建房屋取得日（核發使用執照日）是在新制施行之後，從取得土地到自建房屋出售合計持有年數超過二年，土地部分即須適用舊制，仍然免課所得稅；房屋部分則要適用新制課稅。

如果土地取得日在去年底以前，但建屋後到出售時，土地持有年數未達二年，包括土地及房屋均要按新制合一課稅。財政部表示，此時在計算合一課稅的適用稅率時，應自取得土地所有權日到房產出售日的總持有年數，決定其合一課稅的稅率。

例如，甲分別在2013年6月1日及2016年6月1日買入A、B兩塊土地，並在二筆土地上自建房屋，2019年6月1日房屋同時興建完成，甲在2021年5月31日將房地全出售。

甲出售的房地中，A土地的取得日（2013年6月1日）在去年12月31日以前，出售時持有期間已超過二年，A地應適用舊制，不課土地交易所得稅；在A地上自建的房屋，因是在2016年以後才興建完成，應按新制課稅，其適用稅率是以土地取得日（2013年6月1日）到出售日（2021年5月31日）計算共達八年，因此合一課徵房屋部分的交易所得稅率為20%（超過二年但未達十年）。

至於B地，因為是在今年以後才買進，B地上所建房屋亦是今年以後完成，甲出售B地及B地上的房屋均應按新制課稅，適用稅率也是自取得B地時起算共計五年，甲出售B房、地的合一稅率為20%。