為確保國內稅源不流失，今年7月立法院通過所得稅法第43條之3及4增訂條文，接軌國際反避稅潮流，並克服跨境電商銷售勞務的課稅權爭議，完成反避稅制度的最後拼圖。財政部表示，目前跨境電商在台灣境內若無固定營業場所，但有中華民國的來源所得，就必須繳稅，但繳稅方式不同，若採取扣繳義務人給付，必須支付20%扣繳稅款，但往往造成境內弱勢企業必須自行吸引，形成租稅不公平。

舉例而言，若國內企業透過廣告代理平台，將廣告刊登在Google或fb等社群平台上，每則實付1萬元，廣告代理平台雖實收企業1萬元，但強勢的社群平台要求實拿9000元，廣告代理平台僅賺取1000元，加上其若為社祥平台的扣繳義務人，則還需支付20%扣繳稅款，造成租稅不公平，且利潤難留在境內，加上若追查不到境外獲利情況，也就無法課稅，造成稅源流失。

財政部表示，國外電商課徵所得稅是全球各國當前的課題，目前均已著手在研議中，但現階段仍以營業稅課徵為優先，先調整不公平稅制；至於課徵所得稅如何課徵，包括事後退稅或推計設算扣繳方式等，涉及實務運作可行性，尚無具體方案，但未來不一定須修法，若解釋令可處理之，就用解釋令。

勤業眾信電子商務服務負責人李惠先表示，電子商務雖然是現今最夯的商業模式，但跨境電商較不仰賴在顧客或供應商所在地設立據點，產生了各國營業稅與所得稅課稅困難與稅收流失等問題。

在目前稅制下，如果跨境電商在台灣境內沒有固定營業場所，則不需要辦理營業登記、繳納營業稅，而是由買受人負責繳納營業稅，且交易金額3000元以下免稅；但在買受人為台灣自然人買家的情況下，通常每筆交易金額小但交易筆數多，反向稽徵失效；因此，不僅造成營業稅稅基減少的狀況，也產生跨境電商相較於我國電商，反而不需負擔5%營業稅的不公平競爭問題。

李惠先建議，若要開創跨境電商事業，務必要了解進入市場的直接與間接稅法規及其可能變動、各項稅務遵循義務及成本，以利評估投資架構、因應營業稅之訂價、利潤配置等，達到兼顧稅負效率與稅務風險控管，兩者平衡的營運規劃。