目前國內廠商外銷貨物予物流中心或外商，僅電腦填寫內控表單，並不具有出口效力，外商若想將貨品出口，還得透過原本廠商報關出口，卻可能遇到廠商倒閉。同時，若外商無法向海關報關，仍視為課稅區內的交易，就無法適用營業稅零稅率發票，國稅局不認帳之下，出口貨物無法適用零關稅等糾紛。

因此關務署歷經半年的討論後，近來已預告修正物流中心貨物通關辦法，其中重點即是增訂物流中心自課稅區運入貨物，可由物流中心業者填具出口報單，經完成通關後進儲，同時也增訂外銷貨物存儲期限為兩年，預訂11月初公告實施。

關務署官員表示，若順利完成修法，只要廠商出口貨物予物流中心，透過交易報關憑證，代表貨物視同出口。外商透過我國物流中心採購貨物，可「實際」取得物權，若要將貨物出口到其他地區，仍然適用零稅率，也不用委託廠商填寫出口報單，有利外商將台灣當成亞太轉運中心，鼓勵外資來台投資。

國內業者也會同樣受惠，廠商能縮減作業程序，也可望增加外銷貨物的誘因。官員進一步說，物流中心貨物通關辦法所指物流中心，是經海關核准登記以主要經營保稅貨物倉儲、轉運及配送業務的保稅場所。雖目前受海關監管者僅有約25家，但貿易額占保稅區進出口值達到五分之一。

因此包括服務業、電子業、加工業等只要需要物流的產業都會受惠。官員也解釋說，台灣現有八大保稅區，有1,000多家保稅業者，包括加工出口區、科學工業園區、農業科技園區、自由貿易港區、保稅工廠、保稅倉庫與物流中心，以及免稅商店。

其中物流中心屬單點性質，物流中心只要經海關核准到處可以設立，關務署也希望在修正條文後，對進出口商外銷貨物，能像是便利商店一樣方便，不只可視同出口也能取得外匯。